USPTO Patents Application 10687850

(12) NACH DEM VERTRAG ttBER DIE INTERNATIONALE ZUSAMMENARBEIT AUF DEM GEBIET DES
PATENTWESENS (PCT) VEROFFENTLICHTE INTERNATIONALE ANMELDUNG

(19) Weltorganisation fur geistiges Eigentum
Internationales Biiro

(43) Internationales Veroffentlichungsdaturo
22. Februar 2001 (22.02.2001)

PCT

iiiiiiiiiniiiniDiiiiiiiiiiiiiii

(10) Internationale VerofTentlichungsnummer

WO 01/13115 A3

(51) Internationale PatentklassiOkation 7 : G01N 33/543.
C12Q 1/68

(21) Internationales Aktenzeichen: PCT/DEOO/02758

(22) Internationales Anmeldedatum:

12. August 2000 (12.08.2000)

(25) Einreichungssprache:

(26) VerSffentlichungssprache:

Deutsch

Deutsch

(30) Angaben zur PrioritSt:

199 38 138.0 16. August 1999 (16.08.1999)

DE

(71) An m elder (fur alle Bestimmungsstaaten mit Ausnahme
von US): NOVEMBER AKTIENGESELLSCHAFT
GESELLSCHAFT FOR MOLEKULARE MEDIZIN
[DE/DE]; Ulrich-Schalk-Strasse 3a, D-91056 Erlangen
(DE).

(72) Erfinderjund

(75) ErCnder/Anmelder (mw fur US): BERTLING, Wolf
[DE/DE]; Meisenweg 22, D-91056 Erlangen (DE). HAS-
SMANN, J5rg [DE/DEJ; Hofmannstrasse 118a, D-91052
Erlangen (DE). KOSAK, Hans [DE/DE]; Von- Wit-
zleben-Strasse 23, D-53 1 23 Bonn (DE)1

(74) Anwalt: GASSNER, Wolfgang; Nagelsbachstr.
91052 Erlangen (DE).

49A,

(81) Bestimmungsstaaten (national): AE, AG, AL, AM, AT,
AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, BZ, CA, CH, CN, CR, CU.
CZ, DE, DK, DM, DZ, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM,
HR, HU, ID, IL, IN. IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK,
LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX,
MZ, NO, NZ. PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL,
TJ, TM, TR, IT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW.

(84) Bestimmungsstaaten (regional): ARIPO-Patent (GH,
GM, KE, LS, MW, MZ, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW), eura-
sisches Patent (AM, AZ, BY, KG. KZ, MD, RU, TJ, TM),
europaisches Patent (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI,
FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), OAPI-Patent
(BF, BJ, CF, CG, Q, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE,
SN, TD, TG).

Ver6ffentlicht:

— mit internationalem Recherchenbericht

(88) VerdfTentlichungsdatum des internationalen

Recherchenberichts: 23. August 2001

Zur Erkldrung der Zweibuchstaben-Codes, und der anderen
Abkurzungen wird auf die Erklarungen ("Guidance Notes on
Codes and Abbreviations'*) am Anfang jeder reguldren Ausgabe
. der PCT-Gazette verwiesen.

= (54) Title: METHOD AND DEVICE FOR IDENTIFYING A BIOPOLYMER SEQUENCE ON A SOLID SURFACE

(54) Bezeichnung: IDENTTFIKATION EINER BIOPOLYMERSEQUENZ AUF FESTKORPEROBERFLACHEN

^2 (57) Abstract: The invention relates to a method for identifying a biopolymer spread on a first surface of a solid substrate, whereby
^ the first biopolymer is brought into contact with a second biopolymer which spread on a second surface, whereby said second
1^ biopolymer has an affinity for the first biopolymer, Biopolymer in Kontakt gebracht wird und wobei die Identification des ersten

Biopolymers vorgenommen wird durch Auswertung der durch affinitatsbedingte AdhSsion ausgeldsten Anderung der Impedanz,
W der Leitfahigkeit im Gleichstrom- und/oder Wechselstrombereich in Abhangigkeit von einer aufgepragten Wechselspannungs- oder

Wechselstromfrequenz.

^ (57) Zusammenfassung: Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Identification eines auf einer ersten Oberflache eines Festktir-
persubstrats aufgebrachten ersten Biopolymers, wobei das erste Biopolymer mit einem dazu affinen, zweiten sich auf einer zweiten
Oberflache befindenden Biopolymer in Kontakt gebracht wird und wobei die Identifikau'on des ersten Biopolymers vorgenommen
wird durch Auswertung der durch affinitatsbedingte Adhasion ausgelosten Anderung der Impedanz oder der Leitfahigkeil im Gleich-

^ strom- und/oder Wechselstrombereich in Abhangigkeit von einer aufgepragten Wechselspannungs- oder Wechselstromfrequenz,

INTERNATIONAL SEARCH REPORT

In, ational Application No

PCT/DE 00/02758

1 t' classification of subject matter
IPC 7 G01N33/543 C1201/68

According lo International Patent Classification (IPC) or to both national classification and IPC

B. FIELDS SEARCHED ~ " —

1 Minimum documentation searched (classification system followed by classification symbols) — —

IPC 7 G01N C12Q

1 Documentation searched other than minimum documentation lo the extent thai such documents are included in the fields searched

1 Electronic data base consulted during the international search (name of data ba«A and nr^i^i n — : —

EPO-Internal , BIOSIS, HP I Data

C. DOCUMENTS CONSIDERED TO BE RELEVANT

Category • Citation of document, with indication, where appropriate, of the relevant

Relevant to claim No.

WO 98 31839 A (HARVARD COLLEGE)
23 July 1998 (1998-07-23)
page 28, line 21 -page 34, line 31;
figures 8-16

US 5 567 301 A (STETTER JOSEPH R
22 October 1996 (1996-10-22)
the whole document

ET AL)

WO 98 19153 A (VADGAMA PANKAJ MAGANLAL
;WARRINER KEITH STEWART ROBERT (GB); UNIV)
7 May 1998 (1998-05-07)
claims 1,13,16

EP 0 244 326 A (BIO MERIEUX)
.4 November 1987 (1987-11-04)
page 1, line 21 - line 39; example 5

1-12

1-12

1-12

1-12

J | )( [ Further documents are listed in the continuation of box C.
' Special categories of cited documents : ~ ~~ ~~~

m

Patent family members are listed in annex. .

•A" document defining the general slate of the art which is not
considered to be of particular relevance

'E* earlier document but published on or after the international
filing date

'L' document which may throw doubts on priority cfaim(s) or
which is cited to establish the publication date of another
citation or other special reason (as specified)
"O* document referring to an oral disclosure, use. exhibition or
other means

■P" document published prior to Ihe international filing date but
later than the priority date claimed

T later document published after Ihe international liling date
or priority date and not in conflict with the application but
ciled lo understand the principle or theory underiyino the
invention

■X' document of particular relevance; the claimed invention
cannot be considered novel or cannot be considered to
involve an inventive step when the document is taken alone

■Y' document of particular relevance; the claimed invention

cannot be considered to involve an inventive step when the
document is combined with one or more other such docu-
ments, such combination being obvious to a person skilled
in Ihe art.

document member of the same patent family

Dale of the actual completion of the international search

7 March 2001

Date of mailing of the international search report

26/03/2001

Name and mailing address of the ISA

European Patent Office. P.B. 5818 Patentlaan 2
NL - 2280 HV Rijswijk
TeL (+31-70) 340-2040. Tx. 31 651 epo nl.
Fax: (+31-70) 340-3016

Authorized officer

Hart-Davis, J

Form PCT7ISA/210 (second sheet) (July 1992)

page 1 of 2

INTERNATIONAL SEARCH REPORT

In. Jtionat Application No

PCT/DE 00/02758

C.(Continuation) DOCUMENTS CONSIDERED TO BE RELEVANT

Category '

Dilation of document, with indication. where appropriate, ol the relevant passages

Relevant to claim No.

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c

un 00 A ffHOONG VI FN -IT fHANGMTNG

1-1?
X ic

fiio. MARAfAS GFDRGF fUSV M0T0ROI A JNH

21 December 2000 (2000-12-21)

claims 1,11,12,15,16; examples 1-3

H-W FT MIC f SPHfiNFNRFRGFR- "Flprtriral

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the whole document

A

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T

SOUTEYRAND E ET AL: "Comparison between

1-12

electrochemical and bptoelectrochemical

impedance measurements for detection of

DNA hybridization."

APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY,

vol. 89, no. 2-3, November 2000 (2000-11),

pages 195-207, XP000989714

ISSN: 0273-2289

the whole document .

Form PCT/ISA/210 (ccnfriuation of second shoot) (July 1992)

page 2 of 2

INTERNATIONAL SEARCH REPORT

Information on patent family members

In ationat Application No

PCT/DE 00/02758

Patent document

Publication

Patent family

Publication

cited in search report

date

member(s)

data

WO 9831839 A

23-07-1998

AU

5926598 A

07-08-1998

EP

0981643 A

01-03-2000

US 5567301

A

22-

-10-

-1996

NONE

WO 9819153

A

07-

-05-

-1998

AU

4785497 A

22-05-1998

EP

0934516 A

11-08-1999

EP 0244326

A

04-

-11-

-1987

FR

2598227 A

06-11-1987

AT

93320 T

15-09-1993

DE

3787041 A

23-09-1993

DE

3787041 T

24-03-1994

DE

244326 T

03-11-1988

ES

2002695 T

01-01-1994

GR

88300142 T

16-12-1988

PT

84810 A,B

01-05-1987

WO 0077523 A 21-12-2000 NONE

Form PCT/tSA/210 (patent famiV annex) (July 1992)

INTERNATIONALE]* RECHERCHENBERICHT

In. Jt ion ales Aktenzelchen

PCT/DE 00/02758

A. KLASSiFlZERUNG DES ANMELDUNGSGEGENSTANDES

IPK 7 G01N33/543 C12Q1/68

Nach der Internal ionalen PatentWassiffcation (IPK) oder nach der nationalen Klassifikalon und der IPK

B. RECHERCMIERTE GEBIETE

Recherchiener Mindeslprutstoff (Kiassifikationssystem und Klassifikalionssymbole )

IPK 7 G01N C12Q

Recherchierte aber nichl zum Mindestprufstofl gehorende Veroffenllichungen, sowell dlese unter die rechercbierten Gebiete fallen

Wahrend der taternationalen Recherche konsultierle elektronische Datenbank (Name der Datenbank und evtl. verwendele Suchbegriffe)

EPO-Internal , BIOSIS, WPI Data

C. ALS WESENTLICH ANGESEHENE UNTERLAGEN

Kategorie*

Bezeichnung der Ver6ffentlichung, soweit erforderfich unter Angabe der in Betracht kommenden Teile

Betr. Anspruch Nr.

X

WO 98 31839 A (HARVARD COLLEGE)

23. Juli 1998 (1998-07-23)

Seite 28, Zeile 21 -Seite 34, Zeile 31;

Abbildungen 8-16

1-12

X

US 5 567 301 A (STETTER JOSEPH R ET AL)
22. Oktober 1996 (1996-10-22)
das ganze Dokument

1-12

X

WO 98 19153 A (VADGAMA PANKAJ MAGANLAL
jWARRINER KEITH STEWART ROBERT (GB); UNIV)
7. Ma1 1998 (1998-05-07)
Anspruche 1,13,16

1-12

X

EP 0 244 326 A (BIO MERIEUX)

4. November 1987 (1987-11-04)

Seite 1, Zeile 21 - Zeile 39; Beispiel 5

-/--

1-12

V Weil ere Veroftentlichungen sind der Fortsetzung von Feld C zu |)( 1 Siehe An hang Patenttamilie
I 1 enlnehmen 1 1

° Besondere Kategonen von angegebenen Ver6ffenllichungen
•A* Veroflenlfichung, die den alkjemeinen Stand der Technik definiert,
aber nicht ate besonders bedeutsam anzusehen ist

*E* afteres Dokument, das Jedoch erst am Oder nach dem Internationale n
Anmeldedaium veroftentlicht wordan ist

*V Veroffentlichung. die geelgnet 1st. einen Priorttatsanspnjch zweifethafi er-
schelnen zu lassen, oder durch die das Veroffentlichungsdatum einer
anderen im Recherchenbericht genannten Verbffentlichung belegt werden
soli oder die aus einem anderen besonderen Grund angegeben ist (wle
ausgefuhrt)

'O* VenSftemiichung. ofe sicn aufeine mundlfche Offenbarung.

elne Benutzung. etne Aussteliung oder andere MaOnahmen bezieht
"P" Veroftentfichung, die vor dem intemationalen AnmekJedatum, aber nach

dem beanspruchten Prioritatsdalum veroflentticht worden ist

"T* Spat ere Veroffentlichung, die nach dem intemationalen AnmekJedatum
oder dem Priortatsdatum veroftentHcht worden ist und ma der
Anmeldung nicht kollidiert, sondem nur zum Verstandnis des der
Erfindung zugrundeliegenden Prtnzips Oder der Ihr zugrundeliegenden
Theorie angegeben tsl

•X* Verdffentlichung von besonderer Bedeutung; die beanspruchte Erfindung
kann aflein aufgrund dieser Veroffentlichung nicht als neu Oder auf
erfinderischer Tatigkeit beruhend betrachtet werden

*Y* Veroffentlichung von besonderer Bedeutung; die beanspruchte Erfindung
kann nicht als auf erfindertscher Tatigkeit beruhend betrachtet
werden. wenn die Veroffentlichung mrt einer oder mehreren anderen
Veroftentlichungen dieser Kategorie in Verbindung gebrachi wird und
diese Verbindung fur elnen Fachmann naheliegend ist
Veroffentlichung, die MilgBed dersefben Patentfamifie ist

Datum des Abschlusses der intemationalen Recherche

7. Marz 2001

Absendedalum des intemationaien Recherchenberichts

26/03/2001

Name und Postanschrift der Intemationalen Recherchenbehorde
Europarsches Patentamt. P.B. 5818 Paienttaan 2
NL - 2280 HV Rqswijk
TeL (+31 -70) 340-2040. Tx. 31 651 epo nt.
Fax: (+31-70)340-3016

Bevollmachtigter Bediensteler

Hart-Davis, 0

PCT/1SA/210 (Btatl 2) (Juli 1992)

Seite 1 von 2

INTERNATIONALER RECHERCHENBERICHT

Ini jtlonales Aktenzeiehen

PCT/DE 00/02758

C(Fortsetzung) ALS WESENTLICH ANGESEHENE UNTERLAGEN

Kategorie" Bezeichnung der Verotfentllchung. sowelt ertordertich unler Angabe der in Betracht kommenden Teile

WO 00 77523 A (CHOONG VI EN ;LI CHANGMING
(US); MARACAS GEORGE (US); MOTOROLA INC)
21. Dezember 2000 (2000-12-21)
Anspruche 1,11,12,15,16; Beispiele 1-3

H-W FINK, C SCHONENBERGER: "Electrical
conduction through DNA molecules"
NATURE,

Bd. 398, 1. April 1999 (1999-04-01),
Seiten 407-410, XP002162319
in der Anmeldung erwahnt
das ganze Dokument

S 0 KELLEY, N M JACKSON, M G HILL, J K

BARTON: "Long-Range Electron Transfer

through DNA films"

ANGEW. CHEM. INT. ED.,

Bd. 38, Nr. 7, 1999, Seiten 941-945,

XP002162320

in der Anmeldung erwahnt
das ganze Dokument

SOUTEYRAND E ET AL: "Comparison between
electrochemical and optoelectrochemical
impedance measurements for detection of
DNA hybridization." .
APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY,
Bd. 89, Nr. 2-3, November 2000 (2000-11),
Seiten 195-207, XP000989714
ISSN: 0273-2289
das ganze Dokument

Betr. Anspructi Nr.

1-12

1-12

Formblatt PCT71SA/210 (Fortsetzung von Blatt 2) (Juli 1992)

Seite 2 von 2

INTERNATTONALER RECHERCHENBERICHT

Angaben zu Veroffentlichungen. die zur selben Patenlfamilie geh6ren

Im .donates Aktenzeichen

PCT/DE 00/02758

Im Recherchenbericht

Datum

der

Mitglied(er) der

Datum der

angefuhrtes Patentdokument

Verdffentlichung

Patentfamilie

Verdffentllchung

WO 9831839

A

23-07-1998

AU

5926598

A

07-08-1998

EP

0981643

A

01-03-2000

US 5567301

A

22-10-

1996

KEINE

MO 9819153

A

07-05-

1998

AU

4785497

A

22-05-1998

EP

0934516

A

11-08-1999

EP 0244326

A

04-11-1987

FR

2598227 A

06-11-1987

AT

93320 T

15-09-1993

DE

3787041 A

23-09-1993

DE

3787041 T

24-03-1994

DE

244326 T

03-11-1988

ES

2002695 T

01-01-1994

GR

88300142 T

16-12-1988

PT

84810 A,B

01-05-1987

W0 0077523

A

21-12-2000

KEINE

FamWaa PCT/iSA/210 (Anhang PatemfamiDe)(Ju« 1992)

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